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基因與臨床

基因檢測常見問題解答

發布時間:[2019-10-08 ]
1.什么是腫瘤基因檢測?

        腫瘤基因檢測是通過組織、血液、其他體液或細胞對腫瘤患者的DNA進行檢測的技術,通過特定檢測設備對被檢測者細胞中的DNA分子信息作檢測,分析它所含有的各種基因突變情況,從而能針對性地為每位患者“量身定制”一套最合適的治療方案,最大程度地提高治療的有效率,減少藥物的毒副作用,避免用藥不當貽誤治療時機。腫瘤基因檢測亦是腫瘤精準醫療的基礎。


2.腫瘤基因檢測都有什么用?
        腫瘤組織或血液基因檢測是評估患者使用藥物種類和效果判定非常重要的一環,能從分子層面給醫生用藥予精確的指導,達到提高療效、降低副反應的效果。
1)選擇最有效的腫瘤治療藥物;
2)通過對相關基因的連續動態分析,判定治療效果及耐藥;
3)通過分析基因突變及微衛星穩定性,初步分析腫瘤負荷(TMB)狀態、有助于判定免疫治療藥物應用的有效性;
4)檢測相關基因的狀態,有助于了解腫瘤發生的可能原因。


3. 腫瘤基因檢測panel是什么?
        Panel 是NGS(二代測序,高通量測序技術)技術發展起來的一個詞語,主要指同時檢測多個基因、多個位點。幾個基因可以是一個 Panel,幾十個基因也可以是一個 Panel,幾百上千個基因也可以是一個 Panel,組合在一起我們稱為“基因套餐”。


4.做腫瘤基因檢測的話,是不是panel越大越好?
        首先,目前市場上基因公司超過3000家,有部分公司是不靠譜的,需要選擇有資質有經驗的公司。其次,在真正選擇產品(大中小panel)的時候建議大家根據經濟條件及患者的情況來選擇。比如,一個晚期肺腺癌患者,經濟情況一般,只是為了看看,是否有合適的已經在內地上市的靶向藥可用,那么只要測一下最常見的那幾個基因就可以了。再比如,一個土豪,看看自己是不是有靶向藥可用:不管是已經上市還是處于臨床試驗研究階段的,不管是國內還是國外,都想知道。那么,他可以選擇做盡可能多的、幾十上百甚至全部的基因。PS:有經濟實力,還是建議盡量做大套餐,比如晚期多處轉移的時候,尤其是耐藥的患者,基因突變比較復雜紊亂,早做檢查避免治療青黃不接。大套餐還可以檢查PD-L1、TMB、MSI及MMR的情況,看看是否適合免疫治療。

5. 兩年前的病理切片如果保存完整能否做基因檢測,應該如何選擇樣本?
        疾病是在不斷的發展演變的,而且進展速度比較快,如果您想知道現階段的狀況,就最好不要使用多年前的病例證據,兩年前的病理切片并不能夠如實準確地反映現在的病理狀態。腫瘤基因檢測樣本優先順序:最近手術或活檢新取的組織樣本/胸腹水樣本>1-2年內的組織標本>最新的血液標本>2年以上的舊組織標本。


6. 送檢樣本量與樣本保存的問題。
        新鮮手術組織:黃豆大小,建議使用檢驗所專用的組織保存液;不建議用福爾馬林,如果只能用福爾馬林,送檢單需標注清楚,檢驗所收到會安排特定的抽提方法。
        穿刺組織,細針需要3條,粗針1條即可。
        白片:NGS樣本建議15片左右。PCR或者IHC 5片左右。
        如果樣本量不夠或者不符合要求,檢驗所會要求后續補樣。



7. 為什么檢測出EGFR陰性的腺癌患者使用易瑞沙治療有效?

        有以下幾種情況可能會導致這樣的結果:

1) 檢測方法靈敏度不一樣,是ARMS-PCR,還是NGS? NGS靈敏度更高;

2) 病人的突變豐富比較低,常規靈敏度的檢測就會出現陰性結果,但是低豐度的突變對于TKI的治療也是有效的;

3) 罕見突變,目前,EGFR突變方式大概已經發現了200種,但是臨床上常見的檢測法僅僅涵蓋了最常見的29種,剩下的罕見突變,有一部分是對TKI有效的;

4) 送檢標本是有差別的,血液檢測還是組織活檢檢測,如果是血液活檢,可能存在一定的假陰性;

5) 腫瘤組織存在異質性,活檢的組織剛好是EGFR表達陰性。


8. 什么是腫瘤的免疫治療?

        正常情況下,免疫系統可以識別并清除腫瘤微環境中的腫瘤細胞,但為了生存和生長,腫瘤細胞能夠采用不同策略,使人體的免疫系統受到抑制,不能正常的殺傷腫瘤細胞,從而在抗腫瘤免疫應答的各階段得以幸存。

腫瘤免疫治療就是通過重新啟動并維持腫瘤-免疫循環,恢復機體正常的抗腫瘤免疫反應,從而控制與清除腫瘤的一種治療方法,包括藥物免疫治療與細胞免疫治療。

9.腫瘤免疫治療藥物有哪些?

        根據治療方式對腫瘤細胞或組織是否具有特異性,我們將藥物免疫治療總體分為非特異性和特異性藥物免疫治療兩部分。非特異性藥物免疫治療沒有特別明確的免疫細胞靶點,是從整體上提高人體免疫力從而達到緩解腫瘤癥狀的藥物,又稱免疫調節劑,如國內胸腺五肽、中藥免疫治療藥物;特異性藥物具有明確的靶點與機制,能通過激活或者抑制明確靶點來實現免疫系統對腫瘤的免疫激活,如免疫檢查點抑制劑(PD-1/PD-L1抗體藥物)。目前FDA批準上市的PD-1/PD-L1抑制劑見下表,目前藥企在眾多國內三甲醫院做臨床試驗,提供入組名額(需要滿足入組條件)。



10. 免疫檢查點抑制劑靶標有PDL1、TMB、MSI、MMR等這幾種靶標是否有相關性?

        PD1/PDL1為經典的標志物,但是其特異性較低、檢測受到干擾因素多,且在消化道腫瘤中表達率低,導致其并非為良好的免疫檢查點抑制劑預測標志物。TMB可評估近55%的腫瘤免疫治療的有效性,是未來潛在的良好標志物。MSI/MMR被FDA批準用于所有實體瘤免疫檢查點抑制劑用藥指導; MSI本身就是腫瘤突變負荷的一種形式,MSI-H預示這腫瘤高TMB存在。TMB與PD1/PDL1不沖突,二者結合,可更有效預測免疫藥物的療效,故可聯合檢測。

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双色球2018081期